Que o .NET Core roda no Windows e no Linux isso é mais que sabido. Mas você pode precisar de configurações específicas por tipo de SO. Paths necessários para executar alguma tarefa podem divergir, e esse é o caso do docker. O endereço da API do Docker Daemon é diferente no Windows e no Linux. No Linux você usa unix sockets, enquanto no Windows named pipes.

Então vou apresentar o princípio que permite fazer essa troca de configuração e a partir daí você pode escolher por pelo menos 2 abordagens.

A mágica está na classe Environment e na propriedade estática OSVersion. Na prática a enum PlatformID presente em Environment.OSVersion.Platform é descrita como abaixo:

//
// Summary:
//     Identifies the operating system, or platform, supported by an assembly.
public enum PlatformID
{
    //
    // Summary:
    //     The operating system is Win32s. Win32s is a layer that runs on 16-bit versions
    //     of Windows to provide access to 32-bit applications.
    Win32S = 0,
    //
    // Summary:
    //     The operating system is Windows 95 or Windows 98.
    Win32Windows = 1,
    //
    // Summary:
    //     The operating system is Windows NT or later.
    Win32NT = 2,
    //
    // Summary:
    //     The operating system is Windows CE.
    WinCE = 3,
    //
    // Summary:
    //     The operating system is Unix.
    Unix = 4,
    //
    // Summary:
    //     The development platform is Xbox 360.
    Xbox = 5,
    //
    // Summary:
    //     The operating system is Macintosh.
    MacOSX = 6
}

Isso permite que você possa possa segmentar nós de um único arquivo, como no exemplo abaixo, ou gerar diversos arquivos, um para cada plataforma.

{
    "AppSettings": {
        "Win32NT": {
            "DockerEndpoint": "npipe://./pipe/docker_engine",
            "DataDir": "../data"

        },
        "Unix": {
            "DockerEndpoint": "unix:/var/run/docker.sock",
            "DataDir": "/data"
        }
    }
}

Respeitando o exemplo do arquivo de configuração acima, você pode usar a seguinte estratégia para configurar a injeção de dependência com uma instância configurada:

var entryPointConfiguration = Configuration.Get<EntryPointConfigurationModel>($"AppSettings:{Environment.OSVersion.Platform.ToString()}");
services.AddSingleton(entryPointConfiguration);

No exemplo estou levando em conta apenas Windows e Linux, SO’s de referência para a minha aplicação, já que estou falando de gerenciamento de containers Docker, portanto estou realmente ignorando versões antigas do Windows, Xbox, mas de forma equivocada estou ignorando Mac. Vou tratar de acertar isso, já que esse é um exemplo real.